כל הנהרות בקובה קצרים ונדירים מאוד. יתר על כן, רובו זורם למימי הים הקריבי.
נהר אלמנדרס
מבחינה גיאוגרפית, ערוץ הנהר ממוקם בחלק המערבי של האי ואורכו הכולל הוא 47 קילומטרים. מקור הנהר הוא אגם סקיטו, הנמצא בגובה של 225 מטר מעל פני הים. אחר כך חוצה אלמנדרס את המדינה לכיוון צפון מערב וזורמת למימי מיצר פלורידה (ליד העיר הוואנה).
מי הנהר מזוהמים מאוד. זה מתאפשר על ידי ארגונים רבים - מבשלות בירה, מפעלי בנייה, מתקני אחסון גז ומפעלי נייר.
פארק אלמאנדארם (פארק עיר הבירה) ממוקם על גדת הנהר.
נהר קאוטו
קאטו עובר בארצות המחוזות סנטיאגו דה קובה וגראנה. יתר על כן, זהו הנהר הארוך ביותר באי - אורכו הכולל של ערוץ הנהר הוא 343 קילומטרים.
מקורו של קאוטו הוא החלק הדרום מזרחי של האי, הרי סיירה מאסטרה. לאחר מכן, הנהר חוצה את המדינה בכיוון צפון -מערב ומסתיים במימי מפרץ גואקאנאיו (ליד העיר מנזנילו).
הנהר ניווט רק במסלול התחתון - 110 הקילומטרים האחרונים לפני המפגש. הנהר מזוהם מאוד ואינו יכול לשמש כמקור למי שתייה.