הנהרות של מונגוליה מקורם גבוה בהרים. ורובם הם החלקים העליונים של הנהרות הגדולים ביותר בסיביר ובמזרח הרחוק.
נהר זלטורה
ערוץ הנהר עובר בשטח בוריאטיה (רוסיה) ומונגוליה. ז'לטורה הוא יובל ימינה של נהר דז'ידה. מקור הנהר הוא בארצות מונגוליה. אורכו הכולל של תעלת הנהר הוא 202 קילומטרים, וכמעט כולם עוברים בשטח המדינה. רוסיה מהווה רק 18 קילומטרים של זרם נהר.
הנהר מקבל את עיקר המים במהלך הגשמים. מים גבוהים מתרחשים בקיץ כאשר במונגוליה יורדים גשמים רבים. בפתחו של הנהר נמצאים הכפרים ז'לטורה וטנגרק (בוריאטיה). מי הנהר משמשים באופן פעיל כמקור למי שתייה.
נהר מנזה
התושבים המקומיים קוראים לנהר מינשין-גול. מבחינה גיאוגרפית, הערוץ עובר דרך מונגוליה ורוסיה, כשהוא היובל השמאלי של נהר צ'יקוי. מקורו של מנזה הוא על רכס באגה-חנטאי (מונגוליה). בירידה מההרים, הוא עובר בשטח של אזור טרנס-באיקל וחוזר שוב ממונגוליה. אורכו הכולל של תעלת הנהר הוא 337 קילומטרים.
הנהר מכוסה קרח בסביבות המחצית השנייה של נובמבר. שבירת קרח מתחילה מסוף אפריל. משך ההקפאה הכולל הוא בין 145 ל -180 ימים. בחורף, הנהר קופא מעל 130 סנטימטרים. הנהר מאוכלס: Lenok, taimen, perch, בורבוט, אפרפר ו שפמנון.
נהר אורגון
ערוץ הנהר עובר לחלוטין בשטחה של מונגוליה ואורכו 1124 קילומטרים. אורחון הוא הנהר השני באורכו במונגוליה.
מקור הנהר נמצא בהרי חאנגאי. גדותיו העליונות של הנהר עוברות לאורך עמק צר דמוי קניון. החלקים העליונים של האורגון יוצרים מפל גבוה למדי (20 מטר) ורחב (10 מטר). המסלול האמצעי של הנהר עובר דרך עמק מתפתל עמוק ורק כשהוא יוצא מההרים הנהר מתרחב ל -150 מטר. אורחון מכוסה קרח מנובמבר עד אפריל.
יש הרבה מקומות מעניינים לבקר בעמק הנהר: חארה -בלגאס - עיר עתיקה שהייתה בירת מדינת האויגור; קראקורום היא העיר המרכזית של האימפריה המונגולית. בנוסף, נמצאו כמה קברי קבורה הוניים בעמק הנהר.
נחל אגיעין-גול
הנהר עובר בשטחה של מונגוליה. אורכו הכולל הוא 475 קילומטרים. מקור הנהר הוא מימי אגם חובסוגול. ואז Egin-Gol נושאת לאט לאט את מימיו אל סלנגה הרחוקה. בערך מאוקטובר עד סוף אפריל הנהר מכוסה קרח והופך למקום אטרקטיבי לחובבי דיג החורף. כאן נמצאים - אפרפר, לנוק, טיימן. במסלול האמצעי שלו, הנהר מתפצל לענפים רבים.
